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三氯乙酸酐可用作医药合成中间体，如合成格列本脲，格列本脲是一种降糖效果明显的西药。用来治疗II型糖尿病。截止到2007年，是世界卫生组织药典中两种主要的口服降糖药之一。另外，最近的调查表明格列苯脲通过防止脑肿胀改善了动物的发作模型。后续研究发现，与没有使用格列本脲的患者相比，那些已经服用格列本脲的II型糖尿病患者的NIH发作比率得到改善。本药品通过抑制胰岛细胞的ATP敏感钾通道发挥作用。这种抑制使细胞膜去极化、打开压敏钙离子通道，导致细胞内的钙离子渗透到胰岛细胞，刺激胰岛素的释放。
三氯乙酸酐可用作医药合成中间体，其应用举例如下：
1）合成丙烯酰吗啉。丙烯酰吗啉(ACMO)是一种具有碳碳不饱和双键的水溶性化合物，为无色或淡黄色透明液体。由于丙烯酰吗啉自身无毒，且具有良好的生物相容性，其均聚物常作为药物缓释剂、美容支撑剂等，近年来丙烯酰吗啉在水的净化处理领域取代有毒的丙烯酰胺作为水处理剂应用。
丙烯酰吗啉也是合成树脂的优良助剂和改性剂，用于紫外线固化树脂的反应稀释剂，它易与丙烯酸、丙烯酰胺、明胶等物质发生共聚反应，能够显著改善产品的粘弹性、耐剪切等性能，广泛应用于油田助剂、油墨助剂、造纸助剂和粘合剂等领域。有研究用丙烯酸三氯乙酸酐与吗啉反应生成丙烯酰吗啉单体，所用丙烯酸三氯乙酸酐由丙烯酸与三氯乙酸反应制得。上述合成丙烯酰吗啉的方法，工艺路线简单，反应易于控制；反应条件温和，提高了产品的纯度与收率；所选用的原料价格低廉、产品结构稳定、成本低，具有工业化应用的前景。
2）合成格列本脲。包括以下步骤：1)用三氯乙酸酐保护氨基；2)磺化；3)磺酰胺化；4)酰胺化：5-氯-2-甲氧基苯甲酸与N'N-羰基二咪唑反应后再与化合物III在第二缚酸剂作用下反应；5)加成：加入第二缚酸剂和催化量的冠醚，使化合物IV与环已基异氰酸酯加成，得到格列本脲。所提供的各步骤收率高，底物在保护、去保护、酸处理、碱处理、加水析出等过程中，有效地减少了杂质的残留；采用相转移催化剂配合第二缚酸剂，能有效地提高异氰酸酯与化合物IV的相容性，使亲核反应进行得更加完全，从而得到的产物的纯度更高。
3）制备1,2,4-噁二唑-3,4-二氢喹啉型化合物。喹啉是一种重要的含氮杂环，广泛存在于多种天然产物中，并且许多种含有喹啉结构的药物已经应用于临床。喹啉类化合物的合成和生物活性研究一直是药物化学研究的热点领域之一。研究显示喹啉类化合物具有抗疟疾、抗炎、抗肿瘤、抗细菌和抗结核等多种生物活性。
此外，1,2,4-噁二唑类化合物也具有多种生物活性，如抗肿瘤、抗高血压、抗结核、抗糠尿病等。因此，有研究基于药效团拼合原理将1,2,4-噁二唑结构与喹啉环相连，设计合成了一类新型的1,2,4-噁二唑-3,4-二氢喹啉型化合物，制备方法为：将取代苯甲腈、盐酸羟胺和碳酸钠置于圆底烧瓶中，摩尔比为1：(2-6)：(2-6)，加入乙醇，制得取代N-羟基苯甲脒；将取代N-羟基苯甲脒和三氯乙酸酐置于圆底烧瓶中，摩尔比为1：(1-3)，加入甲苯，得3-取代苯基-5-(三氯甲基)-1,2,4-噁二唑；将3-取代苯基-5-(三氯甲基)-1,2,4-噁二唑和取代1,2,3,4-四氢喹啉置于圆底烧瓶中，摩尔比为1：(1-2)，加入THF，得1,2,4-噁二唑-3,4-二氢喹啉型化合物。本发明所制备的1,2,4-噁二唑-3,4-二氢喹啉型化合物对α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制活性，为抗糖尿病药物的开发和应用提供了新的选择。
[1] CN201711053933.7一种格列本脲的合成方法
[2] CN201510051599.6一种基于酸酐合成丙烯酰吗啉的方法
[3] CN201810449031.3一种1,2,4-噁二唑-3,4-二氢喹啉型化合物及其制备方法和用途