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杆菌肽是1943年由美国哥伦比亚大学的Johnson在从患者的创伤中分离出的枯草杆菌(bacillus sabtilis)中发现的一种含有噻唑环的多肽类广谱抗菌素。
杆菌肽有A、B、C、D、E、F1和G等多种异构体。其中以A组分活性最高，杆菌肽F组分属于氧化代谢产物具有肾毒性。杆菌肽分子中含有 D-氨基酸和L-氨基酸，使杆菌肽对胰蛋白酶、胃蛋白酶等多种蛋白质水解酶和蛋白酶抑制剂及体液均有较强的抗性。
但杆菌肽不稳定、易降解，而当有锌离子、锰离子、亚甲基水杨酸等存在时，可与之结合增强其稳定性和活性，因此在杆菌肽的生产过程中添加硫酸锌、氯化锌或亚甲基水杨酸生成更稳定的杆菌肽锌或亚甲基水杨酸杆菌肽，且其效价在干燥状态，即使在酸性、碱性和热环境中，其稳定性也较好。
亚甲基水杨酸杆菌肽分子式
杆菌肽属于多肽类抗生素，其抗菌谱与青霉素相似，对革兰氏阳性菌如梭状芽孢杆菌属、葡萄球菌属，部分革兰氏阴性菌如脑膜炎双球菌、流感杆菌，螺旋体，放线菌等均有抑制作用，且对于魏氏梭菌尤其敏感。
其抑菌作用机制主要是三重抑菌机制：
抑制细胞壁合成：抑制磷脂载体的运转，从而阻碍向细胞壁支架输送粘肽；
损伤细胞膜：增加细胞膜通透性，导致胞内各种离子、氨基酸、嘌呤等物质外流；
干扰胞内原浆蛋白合成，使细菌生长繁殖受阻。
此外，杆菌肽还可提高肠道黏膜中免疫球蛋白含量，从而提高机体免疫功能。通过促进机体TLR受体表达，活化 NF-κB信号途径，引起细胞因子表达，增强机体天然免疫反应。
由于杆菌肽本身的不稳定性质，因此在运用到生产时，常使之与锌离子或亚甲基水杨酸结合，形成杆菌肽锌或亚甲基水杨酸杆菌肽。目前该系列产品主要用于动物促生长剂添加于饲料中，或作为治疗因梭菌等革兰氏阳性菌感染引起的肠道问题。
杆菌肽锌的配伍禁忌少，能与多种抗生素联用，达到预防、治疗疾病的作用。能与氨丙啉、洛克沙胂、依索巴、氯羟吡啶、癸氧喹酯、拉沙洛西、莫能霉素、甲基盐霉素、尼卡巴嗪、盐酸氯苯胍、盐霉素、球痢灵和阿散酸等联用13种抗球虫药联用。与青霉素G、链霉素、新霉素、多黏菌素等均有协同作用，而与喹乙醇、恩拉霉等存在颉颃作用。并且，杆菌肽锌作为强的杀菌剂，细菌对其不易产生抗药性及交叉耐药性。因此，在养殖生产中杆菌肽锌常与其他抗生素联用。此外，在消化液和肠道菌群的作用下，杆菌肽锌被降解为杆菌肽和锌离子，锌离子被机体吸收利用，而杆菌肽因特殊的结构很难被肠道吸收，从而为更好发挥抑菌效应奠定基础，同时也减少杆菌肽在动物性产品中的残留。
人们对于亚甲基水杨酸杆菌肽和杆菌肽锌多年来做了许多研究。现在的研究认为同一类的药物，由于结构上细小的改变，或者所结合的集团有变化，其性质就会发生巨大变化。
亚甲基水杨酸杆菌肽作为新二代杆菌肽，其分子量更大，且肠道溶解性更佳，可在小肠等作用部位发挥最大的抗菌作用而且不被吸收。与球虫药的配伍种类除与杆菌肽锌相同外，还能与地克珠利、氢溴常山酮以及塞杜拉霉素联用以防治球虫。此外，亚甲基水杨酸杆菌肽还具有很好的治疗功能，研究发现其可以控制家禽中由梭状芽孢菌引起的坏死性肠炎，由短螺旋体引起的猪痢疾，与金霉素配伍可很好控制由胞内劳森氏菌引起的猪回肠炎。
纵观现今动物使用的抗生素，杆菌肽系列产品具有排泄快、配伍禁忌少、无残留、不易产生抗药性等优点而被广泛用于畜禽养殖业中，能带来可观的经济效益。合理使用杆菌肽锌、亚甲基水杨酸杆菌肽可以增强机体免疫力，预防、治疗胃肠道疾病，维持畜禽的健康在一个较高水平。在畜牧生产管理过程中，合理使用抗生素，遵循科学的休药管理规定，或者选择使用机体不吸收，无残留，零休药期的抗生素，使畜产品中抗生素残留符合国家食品卫生安全管理规定，才是真正的健康养殖。才能为高品质的畜禽产品生产、为消费群体带来安全保障。