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牙周病是指患者牙周组织出现牙菌斑，引起的牙周组织疾病，包括牙龈炎、牙周组织炎症两种情况，临床表现为牙龈出血、牙龈疼痛、牙齿松动、咀嚼功能下降等症状，严重者出现牙齿脱落、牙周脓肿情况，影响患者外观形象和生活质量。在牙科领域中，牙周病和龋齿是引发牙齿缺损的罪魁祸首，是发病率较高的疾病。牙周炎已被世界卫生组定论为继恶性肿瘤、心脑血管疾病之后，威胁人类身体健康的第三大杀手。西吡氯铵可有效地治疗牙周病。
西吡氯铵是一种使用广泛的杀菌消毒剂，在国外已被广泛应用于口腔卫生保健。西吡氯铵为氯化十六烷基吡啶水合物，属阳离子表面活性剂，主要通过降低表面张力，增加细胞的通透性而抑制或杀灭细菌。
有治疗牙周病的临床疗效报道指出，对牙周病患者采用西吡氯铵含漱液治疗，与使用复方氯己定含漱液治疗相比，其对口腔致病菌和非致病菌抑菌效果更佳，不良反应发生机率更小，治疗安全性更高，能够更有效改善患者牙菌斑含量，提高牙龈健康情况。还有研究表明，西帕依固龈液联合西吡氯铵治疗牙龈炎，可以显著改善患者临床症状，抑制炎症反应，还可修复正常细胞功能。
2017年国内16城市样本医院口腔用药市场为1911万元，其中用于治疗牙周病的药物市场为1510多万元，同比上一年增长了31.19%，其增长率明显高于其它品种。
口咽局部抗菌剂，可用于口腔感染性疾病的辅助治疗。
适用于治疗敏感细菌引起的轻、中度细菌性结膜炎。