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FMOC-L-天冬氨酸可用于有机合成反应。1970年代末以来，Fmoc固相肽合成已被确立为最温和便捷的肽合成方法。由于Fmoc基团对碱基不稳定，因此可以在比Boc方法严格得多的酸性条件下除去FmocSPPS中氨基酸的侧链保护基。然而，BocSPPS仍然是一种竞争性方法，特别是对于长肽。Boc化学基于对酸敏感的两种类型的对酸敏感的保护基的组合：对I/-保护的临时性叔丁氧羰基（Boc）和对亲核氨基酸侧链的半永久保护基，通常是（取代的）苄基酯或醚（Bzl，2-CI-Bzl，2，6-二-Br-Bzl），苄氧羰基（Z）及其衍生物，例如2-氯苄氧羰基（2-CIZ）和具有可比的酸稳定性的其他基团，例如对Arg的对甲苯磺酰基（甲苯磺酰基，Tos）。Boc基团在肽延长的每个循环中被中等强度的酸（通常为三氟乙酸（TFA））以10-100％的浓度除去。其他保护基团必须相对具有TFA抗性，以防止由于氨基酸侧链的过早暴露而引起的副反应。
FMOC-L-天冬氨酸制备如下：
将两毫克的氨基酸衍生物称入旋盖玻璃小瓶（1cm3）和1cm3的HFIP中的0.1N（约0.37％w/v）盐酸中（10μl约37％HCl水溶液）加入每990μlHFIP）。将溶液静置，然后通过RP-HPLC分析。从三苯甲基阳离子的强烈黄色的外观判断，HFIP中0.1NHCl从Fmoc-Asp（OtBu）-OH中去除/V-Trt基团几乎是瞬间的。反应10分钟后，通过HPLC无法辨别痕量的起始原料，得到FMOC-L-天冬氨酸。
[1] WO2014033466 - METHOD AND COMPOSITIONS FOR REMOVING ACID-LABILE PROTECTING GROUPS