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雷贝拉唑与奥美拉唑都属于质子泵抑制剂。所谓的质子泵，即H+/K+-ATP酶，是胃酸分泌的最后环节。质子泵抑制剂可高效、快速的抑制质子泵而减少胃酸分泌，是目前治疗胃和十二指肠溃疡、反流性食管炎、胃幽门螺旋杆菌感染等消化道疾病最先进的一类药物。和其他类的抑酸药相比，质子泵抑制剂抑酸作用强，特异性高，持续时间长久。
奥美拉唑于1987年在瑞典上市，是第一个上市的质子泵抑制剂，有人将其视为第一代质子泵抑制剂；雷贝拉唑于1999年在美国上市，是第四个上市的质子泵抑制剂，有人将其视为第三代质子泵抑制剂。一般而言，新上市的药物和之前的药物比，或者疗效提高，或者副作用减小。
2009年美国俄勒冈州卫生与科学大学对5种常用的质子泵抑制剂（奥美拉唑、埃索美拉唑、兰索拉唑、泮托拉唑、雷贝拉唑）进行了头对头的比较，结果显示5种药的抑酸效果与不良反应并无显著差异，个体选择不同药物的主要考虑因素是药品的价格和患者的反应。
但此后其他学者的研究却有不同的结果。研究发现，埃索美拉唑的抑酸作用最好，其次为雷贝拉唑，而泮托拉唑、兰索拉唑与奥美拉唑的抑酸强度相似。从疗效上说，雷贝拉唑要优于奥美拉唑。
进餐后是质子泵最活跃的时候，所以质子泵抑制剂的最佳服药时间是餐前即服，而只有奥美拉唑例外。食物可以减少奥美拉唑的吸收达33～50%，所以奥美拉唑应在餐前1小时服用。
雷贝拉唑与H+/K+-ATP酶的结合位点最多，因此起效最快，奥美拉唑起效要慢一些。衡量抑酸持续时间的方法为监测服药后24小时内胃液PH>4的时间百分比。研究结果显示，埃索美拉唑的抑酸持续时间最长，奥美拉唑和雷贝拉唑差别不大。
奥美拉唑可用于儿童，雷贝拉唑儿童能否使用没有相关研究报道。孕妇用药：雷贝拉唑的妊娠药物的安全等级为B级，奥美拉唑为C级，雷贝拉唑对孕妇相比奥美拉唑要安全一些。
肝脏中有一组专门用于药物代谢的酶叫细胞色素P450（CYP），这是一个大家族，家族中有许多成员。每一个酶“掌管”着不同的药物代谢，每个药物也都有各自的代谢途径。奥美拉唑通过CYP中的2C19酶代谢，而氯吡格雷也通过这个酶代谢。一方面，奥美拉唑与氯吡格雷相互竞争这个酶，另一方面，奥美拉唑的代谢产物还抑制这个酶，所以，奥美拉唑就会影响氯吡格雷的活性。美国FDA公布的资料显示，奥美拉唑可以减少氯吡格雷45%的活性，降低其抗血小板作用47%。所以近年来美国FDA特别强调，质子泵抑制剂中的奥美拉唑勿与氯格吡雷合用，其他质子泵抑制剂不受影响。
而雷贝拉唑主要经过“非酶”（非CYP）的途径代谢，很少干扰其他药物的作用。总的来说，雷贝拉唑稍优于奥美拉唑。