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四环素类的抗菌谱包括：G+与G-需氧菌和厌氧菌、立克次体、螺旋体、支原体、衣原体及某些原虫。四环素类对G+菌的抗菌活性较G-菌强，在G+菌中，葡萄球菌敏感性最高，化脓性链球菌与肺炎球菌其次。米诺环素的脂溶性明显高于其他四环素类药物，抗菌活性进一步加强。抗菌活性：米诺环素＞多西环素＞美他环素＞金霉素＞四环素＞土霉素。
米诺环素的脂溶性明显高于其他四环素类药物，抗菌作用更强，对组织渗透性更好，但也能在中枢神经系统达到较高浓度，这是其前庭和耳毒性大的主要原因。——米诺环素引起的前庭反应包括头晕、眩晕等，尤其多见于女性。建议患者不要驾驶、操作机械、高空作业。米诺环素可诱导红斑狼疮和自身免疫性肝炎，大多数病例发生于年轻女性用于治疗粉刺。发生风险很低，但证据充分。长期服用米诺环素可引起皮肤、粘膜、指甲、甲状腺、口腔、眼及骨的色素沉着，但也有短时间（3~28天）使用出现皮肤色素沉着的报道。维生素C 可能会减轻色素沉着。
目前我国肺炎支原体对大环内酯类药物耐药率高，肺炎支原体肺炎首选口服多西环素或米诺环素。
四环素类抗菌药物对痤疮丙酸杆菌敏感，在毛囊皮脂腺中浓度较高，而且兼有非特异性抗炎作用，首选口服多西环素或米诺环素。相较于多西环素，米诺环素的皮脂腺中浓度更高，但有增加药物诱导性狼疮和自身免疫肝炎的风险，包括皮肤色素沉着风险。——四环素类药物禁止与口服维A酸类药物合用，否则可引起颅内压升高。
非淋球菌性尿道炎常见病原体为衣原体或支原体，首选多西环素或阿奇霉素。
多西环素和米诺环素具有抗炎作用，多西环素：每次20mg，每日2次，可用于牙周病、玫瑰痤疮（酒糟鼻）治疗。多西环素（40mg/天）的亚抗菌剂量，具有抗炎作用而无抗菌作用，可最大程度避免使用抗生素可导致的菌群失调和细菌耐药发生。
国内有临床研究发现，米诺环素，200mg/天，连续口服5 天，可改善缺血性脑卒中患者的病情。
基质金属蛋白酶（MMP）的表达和恶性肿瘤的侵袭和转移呈正相关。Zn2+是基质金属蛋白酶活性中心，Ca2+是辅助离子。四环素类抗菌药物是一类强的金属离子螯合剂，可通过与Zn2+ 螯合，抑制MMP 活性，对炎症以及血管生成、肿瘤细胞的侵袭与转移等有一定作用。
美国风湿病协会在类风湿性关节炎治疗指南中将米诺环素列为缓解病情药物之一，但国内相关指南未被推荐米诺环素。