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次氯酸钠以其高效杀菌、溶解有机组织等突出性能，成为临床最常用的冲洗剂。其最主要作用方式是通过水解形成次氯酸，再进一步分解成新生态氧，使细菌和病毒蛋白变性，从而发挥广谱杀菌作用。
次氯酸钠(NaClO)是用发生器的钛阳极电解食盐水而得，反应如下：
NaCl+H2O→NaClO + H2↑
次氯酸钠在水中水解形成次氯酸和氢氧化钠，反应如下：
NaClO+ H2O→HClO + NaOH
次氯酸钠消毒液用于消毒的有效成份是HClO，HClO在水中离解，反应如：
HClO ⇋ H+ +ClO-
HClO由于受水中某些杂质或光线的影响，会产生解，反应如下：
2HClO ⇋ 2HCl+ O2↑
次氯酸钠是一种高效氧化剂，在水中以 HClO 和 ClO两种形态存在，HClO 极不稳定， 易分解出 O2。新生态的氧具很强的氧化能力，能破坏有机色素基团，使有色物褪色。所以，在造纸业用于漂白纸浆，纺织业中用于漂白织物。另外，次氯酸钠在无机化工、染料、冶金、医药、轻工、农牧方面均有用途。在工业用水和饮用水处理领域中，次氯酸钠溶液可作杀菌灭藻剂使用时将工业品次氯酸钠溶液加水稀释，直接用耐腐蚀的泵加入水系统. 次氯酸钠入水后有次氯酸(HClO)生成，它是杀菌灭藻的主要有效成分。HClO 能对水中有臭味的无机物彻底氧化消除，使水得以净化，保护工业输水设备，使饮用水水质达到国家规定标准，保证人体健康。
医院是各种病人群集治疗的场所，也是病原微生物栖息繁殖和感染者集中的地方。空气中存在的大量致病微生物，可随着尘埃和飞沫通过呼吸道、皮肤、粘膜等途径侵入机体，这是医院感染的重要原因。采用次氯酸钠消毒液喷雾消毒门诊，病房及各诊疗室，治疗室，自 1996 年以来开始试用次氯酸钠消毒液进行空气喷雾消毒。消毒后，空气细菌含量结果达到规定的标准，故有效的空气消毒可降低医院内交叉感染的发生率。次氯酸钠消毒剂是一种含有效氯和表面活性剂，对细菌、芽孢、病毒、结核杆菌增多有较强的杀灭作用。经过次氯酸钠空气喷雾之后，空气细菌含量显著下降，是一种纯天然原料配制成的含氯消毒剂，能渗透各种有机物，快速杀灭多种细菌、病毒，作用快，效果好，是一种高效消毒剂。
当次氯酸钠投入循环水池中以后, 它可穿透细菌的细胞壁, 从而杀死细菌及藻类。杀灭的藻类死亡后从波型板及池壁脱落, 形成淤泥并沉入池底, 从而改善了现有冷却塔的热交换效果。在加药的间断期间,水中的残留次氯酸钠对细菌及藻类生成还有一定的抑制作用, 从而还能减缓藻类的再次形成速度。
冷却循环水投加次氯酸钠消毒, 的确可以有效地杀死滋生的细菌与藻类, 对提高冷却塔的换热效果起到很大的作用。次氯酸钠作为杀菌消毒还是比较经济的, 具有广泛推广应用的前景。
植物开放式组培技术的关键在于找到有效的抑菌剂，目前利用抗生、农药、家用消毒剂、植物提取物、食品添加剂等作为抑菌剂方面的研究均有道，但用次氯酸钠作为抑菌剂方面的报道在国内尚未见报道，国外仅报道过次氯酸钠用于几种观赏植物的开放式组。次氯酸钠是含氯消毒剂中最为常用的一种，其杀菌谱广，作用迅速低毒，价格低廉，而且对病毒、细菌、真菌和芽孢均有较强的杀灭能力。
根据文献，次氯酸钠可作为香蕉开放式培养的抑菌剂，以浓度在0.01％~0.02％之间最好。
次氯酸钠液体投入水中，瞬时水解形成次氯酸和次氯酸根，因次氯酸是很小的中性分子，不带电荷，能迅速扩散到带负电的菌(病毒)体表面，并通过细菌的细胞壁，穿透到细菌内，次氯酸极强氧化性破坏了菌体和病毒上的蛋白质等酶系统；从而杀死病原微生物。